融合基因： 是致癌魔鬼还是治癌天使？(2)

最新研究中，哥伦比亚大学医学中心及其合作者分析了来自43种不同癌症类型的1000多种人类癌细胞系中的8000多种融合基因。他们发现，90％的融合基因在癌症中并不起重要作用，但当从病人肿瘤的基因组重排推断癌症的原因时，“这些结果应该被考虑”。

 

现有检测方法优劣并存

 

融合基因通常是将两个或多个基因的编码区首尾相连，构成嵌合基因。根据构成，既有对功能基因进行示踪、研究其功能及特性的功能性融合，也有利用信号肽或单体序列携带目的基因高效表达，从而提取纯化目的蛋白的融合；还有增强基因功能、扩大基因应用范围的融合等。

 

正因为融合基因的发现，有可能成为诊断癌症的标记或者药物的靶点，因此融合基因检测对癌症临床诊疗及预后都具有实际意义，可以指导临床医生制定科学的治疗方案，避免发生治疗不足或过度。

 

陈策实介绍，基因融合检测的金标准是荧光原位杂交（FISH），这种方法可以检测目标基因在染色体中的定位，从而判断是否有基因异位的发生，但实验操作复杂、技术要求较高；其次，免疫组化（IHC）也是常用的检测方法之一，是利用特异性抗体检测目的蛋白表达水平的方法，能够显示靶标蛋白是否表达，以及表达量是否有改变，缺点是通常无法直接检测融合基因，对结果的判读主观性较强；第三个方法是反转录PCR（RT-PCR），优点是可操作性强，设计出针对已知融合基因的PCR引物，能简便快速地进行检测和判断。这三种技术只适用于肿瘤组织样本，限制了应用的拓展，因为很多晚期癌症患者无法进行手术取样，因此无法使用这些检测技术检测融合基因的状态。

 

但高通量测序（NGS）和微滴式数字PCR技术（ddPCR）不同，它不仅可以检测组织样本中的融合基因，还适用于非创伤手段获取的样本如血浆等样本，进行肿瘤融合基因的检测；NGS还可以一次检测多种基因、多种融合变体，发现未知变异，但实验操作和数据分析都很耗时，对样本的要求较高；ddPCR是对检测样本采用微滴化处理后进行PCR扩增，从而对少量样本进行多个基因位点的检测，缺点是无法对未知的融合基因进行检测。

 

陈策实认为，这些融合基因的检测方式各有优劣，往往需要结合多种检测方式，进行综合判断。