国际竹藤中心首次成功破解棕榈藤全基因组信息
北京12月29日 (杨佳欣)29日,竹藤基因组学学术成果发布会在北京举行。记者从会上了解到,继2013年首次破解竹子基因组后,2018年国际竹藤中心又首次成功破解了2种棕榈藤的全基因组。
2018年国际竹藤中心首次破解棕榈藤基因组信息,并且一次完成了2个棕榈藤藤种,即单叶省藤和黄藤的基因组测序、组装和注释工作。同时完善和提升了毛竹基因组精度,达到染色体水平。相比于之前毛竹基因组的工作,组装质量更高,注释结果更全面。
据介绍,这项成果2018年8月已发表在世界权威基因组学杂志《大数据》上。这是全球首次发布棕榈藤全基因组数据。
国际竹藤中心主任江泽慧表示,这些数据不仅为开展棕榈藤功能基因组学研究提供了基础遗传信息,促进种质资源的育种应用,而且还作为开展棕榈藤种间及不同物种之间的比较研究,提供了参考基因组。
据了解,棕榈藤是热带和南亚热带森林宝库中的多用途非木本植物资源,原藤是仅次于木材和竹材的重要林产品,具有重要的生态和经济价值。全球每年藤工业产值约为70亿美元。单叶省藤和黄藤两个染色体水平的全基因组测序工作的完成,填补了世界棕榈藤基因组学研究空白,也标志着中国棕榈藤生物学基础研究取得了重大突破。
中国科学院院士杨焕明表示,本次发布的竹藤基因组学术成果不仅对竹藤植物对具有重要意义,而且对整个基因组学的发展也具有重要意义。
此外,江泽慧在会上透露,预计到2019年,国际竹藤中心还将完成3-5个竹种和2-3个棕榈藤藤种的全基因组测序和组装工作。在2020年左右,国际竹藤中心将发布和维护累计10个以上的竹藤基因组数据。(完)