好消息!上海光源“加入”抗疫情行列(2)

光山新闻网 林晓舟 2020-02-03 21:06:44
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这个环节是一个由多个蛋白质组成的复合体介导进行的过程。我们发现,新冠病毒转录复制复合体的这些蛋白亚基的氨基酸组成序列,跟SARS病毒的相似性比较高,有90%以上的相似性。

?《中国科学报》:这个相似度有什么指导意义?

● 施一:

第一个层面,如果它有较高保守性的话,有助于我们研究针对冠状病毒的广谱性靶向药物。

比如我们可以针对聚合酶,基于它的结构做一些药物的虚拟筛选,这可以帮助我们找到有潜力抑制转录复制过程的化合物分子,通过进一步评价来找到一些可用的老药或开展新药研发。

?《中国科学报》:蒋华良院士和饶子和院士领衔的中科院上海药物研究所和上海科技大学联合应急攻关团队,此前找到的30种可能对新冠病毒有治疗作用的药物,是否就是基于这个方法?

● 施一:

正是,他们靶向的是病毒蛋白水解酶。

我们也开展了相应工作,靶向的是病毒聚合酶(及其复制相关蛋白)。这个聚合酶(及其复制相关蛋白)跟病毒的转录、复制有关系。

我们通过虚拟筛选,也筛到了一些有潜力的化合物分子,现在正在进行活性评价——看看它们是否如我们预测的那样有抗病毒活性。

此外,我们也在实验室进行药物靶标的验证,看它是是否能具有对病毒复制转录的抑制活性。

这个工作(如有突破)除了帮助发现一些老药之外,也有助于新药物的研发。

?《中国科学报》:在这个环节还有哪些重要的工作?

● 施一:

有的。尽管新冠病毒与SARS病毒有比较高的相似性,但二者在氨基酸层面还有些差别,这也使得二者在传播特性和致病病理上有所不同,比如新冠病毒潜伏期更长、致死率更低。

这涉及病毒与宿主的相互作用,因此我们希望比较一下新冠病毒在入侵和复制、转录的特性上与SARS病毒有什么差异,通过结构解析能否给出一些解释,更加清晰地了解其致病机制。

?《中国科学报》:在病毒在宿主细胞内的组装环节,你们主要解析哪些(个)蛋白的结构?

● 齐建勋:

病毒在组装之前,其基因组会被一种称之为N蛋白的蛋白包裹、保护起来,之后再进行组装。我们现在也在研究N蛋白的结构,看它是如何帮助病毒组装的。

?《中国科学报》:这部分研究预计有哪些收获?

● 施一:

第一,当人被感染的时候,其体内或血液中会产生抗N蛋白的抗体,我们基于此在做一些检测试剂的研发,通过检测体内是否含有抗N蛋白抗体,来开发成可实现快速检测的试纸条。

第二,除了用于检测之外,N蛋白是帮助病毒粒子组装非常重要的一个蛋白质,只要我们了解了它的工作机制,将来就能够针对这个结构去开发一些抗病毒的药物等等。

“我们尽可能往前赶”

?《中国科学报》:你刚才说光源衍射数据好不好,主要取决于蛋白晶体。现在你们已经有哪些晶体?

● 齐建勋:

我们现在已经有了N蛋白的蛋白晶体;涉及入侵的S蛋白及受体复合物,我们已经点了晶体,还要观察一下晶体是否长了出来。

?《中国科学报》:在你们这一系列工作中,有没有一些马上可投入临床应用的成果?

● 施一: