一剪寒梅:她在最冷枝头绽放(2)
郝沛所在的中国科学院上海巴斯德所,是2003年“非典”疫情之后,中国科学院为对抗传染病成立的研究所。这个初心也是整个研究所多年来不畏艰难、砥砺前行的动力。这也是中国科学院上海巴斯德所吸引郝沛的重要原因。“我是本土成长的研究员,我感谢上海巴斯德所给我独立成长的机会。” 没有海外留学经历的郝沛心存感恩。
新冠肺炎疫情发生以来,中国科学院上海巴斯德所迅速行动,组建了科技攻关团队,所长、党委委员唐宏同志担任科技攻关临时党支部书记。
1月27日,大年初三,郝沛和中国科学院上海巴斯德所科研骨干一起在科技攻关《请战书》上郑重签上了自己的名字,《请战书》中写道:“我们愿为战胜新型冠状病毒疫情随时听候调遣,我们全体队员都义无反顾!”
“我们家,我爸爸和我都是党员,我是在上海交通大学读大二的时候入的党。”1月31日,大年初七,拥有25年党龄的郝沛积极响应研究所所党委的号召,递交了自己的“特殊党费”,为抗疫奉献“老党员”的一份深情。
病毒基因组自动化鉴定云平台(VIC)上线
“从年前至今,我们的工作一直没有停止。”对于最新的工作进展,郝沛介绍说,“我们和中国科学院上海营养与健康研究所共同开发了病毒基因组自动化鉴定云平台(Virus Identification Cloud, VIC),直接对接人体样本的RNA二代测序原始数据,具有对数据全自动质量控制、拼接和病毒组成分析等功能,实现了快速检测样本中可能存在的包括新型冠状病毒在内的各种病毒,并在线分析其相对载量。”
郝沛表示,开发这个平台的目的是希望能够用擅长的生物信息学技术,协助医院机构很快作出专业判断。
“目前我们已经协助上海市公共卫生临床研究中心和上海交通大学医学院进行临床样本数据分析。我们还在改进流程,希望能基于这个流程构建病原大数据分析平台,在疫情过后对更多的病原微生物进行分析监测。”
对于新型冠状病毒的溯源研究工作,郝沛说:“我们在努力分析研究野生动物病毒结合受体的数据,模拟预测其病毒S蛋白接合的能力,从分子生物学角度筛选新冠病毒的中间宿主野生动物。”郝沛补充道,“我们也在搜集整理已经公开的相关野生动物的转录组测序数据,进行数据分析。”
疫情当前,科研不止。当初春的阳光透过法国梧桐树洒在科学大院的时候,郝沛和她的队友们坚信:总有云开日出时。
因为,春天的脚步已经到来。
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