玉米多组学数据库买通“信息孤岛”
玉米多组学数据库买通“信息孤岛”
克日，华中农业大学传授严建兵课题组乐成整合了来自于同一玉米群体的基因组、转录组、表型组、代谢组等多组学数据，构建了一个玉米属综合数据库ZEAMAP（），并内嵌了基因组“欣赏器”和“搜索引擎”，实现对相关组学数据的高度集成、快速检索和智能阐明。
据先容，玉米是我国最重要的农作物之一，但我国粹者对玉米基本研究的质料和数据收集恒久依赖国际数据库，海内玉米研究的质料和数据的共享平台亟待增强。同时，现有的玉米数据库大多存眷一种或特定几种组学数据，差异数据库之间难以有效整合操作，形成了一个个“信息孤岛”。
为办理这一困难，严建兵课题组以被海表里同行遍及利用的玉米关联群体为基本举办数据收集，通过整合该群体的基因组、转录组、表型组、代谢组、表观基因组、遗传变异以及遗传定位功效等多组学数据，构建了一个玉米属综合数据库ZEAMAP。
该数据库同时收录了4个玉米基因组和1个大刍草基因组，并举办了具体的成果注释，内嵌了基因组“欣赏器”以及富厚的数据检索、阐明和展示东西，可以直观地比拟力基因组、基因共线性区块、表达模式聚类、遗传变异基因型、连锁图谱、遗传定位功效、染色质交互、组卵白修饰以及群体程度的DNA甲基化等多组学数据举办检索和阐明，并提供相应的条目链接，实此刻差异组学数据之间举办跳转会见。
严建兵课题组暗示，将一连维护和更新该数据库，开放共享数据和质料，接待宽大科研事情者利用并提改造意见。并等候这一云端集成检索有效促进对玉米现有组学数据资源的操作，有助于深入领略玉米遗传变异、表型和基因之间的干系，帮助玉米的遗传育种和改善，配合促进科学事业的成长。
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