重测序功效展现枣树发源于山西
重测序功效展现枣树发源于山西—陕西地域
全基因组选择消除阐明及调控含仁率的候选基因筛选 洛阳师范学院供图
克日，《植物生物技能》在线颁发了洛阳师范学院传授赵旭升课题组的研究成就。他们通过对漫衍遍及的493份枣种质（包罗202份野生种和291份栽培种）举办基因组重测序，团结群体基因组进化阐明、全基因组关联阐明系统展现了枣树的发源、驯化汗青，理会了枣树重要园艺性状变异的遗传基本，为后续其他重要性状的研究奠基了基本。
洛阳师范学院生命科学学院青年西席郭明欣和北京诺禾致源科技股份有限公司张钟仁为本论文配合第一作者。洛阳师范学院生命科学学院赵旭升传授和北京诺禾致源科技股份有限公司江文恺为配合通讯作者。
论文配合通讯作者赵旭升先容，枣树发源于中国，今朝已有7000多年的栽培汗青。公元前100年前后，枣树就已流传到韩国、日本等亚洲邻国，后沿丝绸之路流传到西欧等国。基于古文献中对付枣树的记实和今朝古枣树的漫衍，研究人员认为，黄河中下游地域，出格是晋陕峡谷，是枣树的发源地。
栽培枣树由野生酸枣颠末恒久的选择驯化而来，在驯化进程中许多重要的园艺性状，譬喻含仁率、单果重等产生了显著的改变，然而今朝对付这种变异的分子基本仍然知之甚少。
赵旭升先容说，枣树的发源地一直缺乏科学的证据。该研究首次按照大局限的基因组重测序，团结群体进化阐明，认为山西—陕西地域是栽培枣树的发源地，且山西地域早于陕西地域。该研究成就提出，枣树从主要的发源地流传到我国东部地域，再流传到我国南部。
在野生酸枣驯化为枣树的进程中，其生殖系统产生了显的改变：由有性生殖演化为无性生殖。野生种一般含有种子，而大都栽培种没有种子或具有较低的含仁率（含有丰满种子的枣核数/所有枣核数）。
为了展现这种演化的分子机理，该研究操作重测序的数据举办了选择消除和全基因组关联阐明，筛选到部门调控含仁率的重要候选基因。
单果重是枣树的一个重要驯化性状，在驯化进程中，单果重明明增大。然而对付这种变异的分子机理仍然所知甚少。该研究整合全基因组关联阐明、候选基因的表达阐明及转基因验证，在第一号染色体发明白一个编码泛素特异卵白酶基因ZjDA3，其节制着枣的单果重和果实巨细。
据悉，该研究还通过对栽培种中制干种和鲜食种两大类举办了较量群体基因组阐明，筛选到部门调控果实甜度和脆度的基因。
相关论文信息：https://doi.org/10.1111/pbi.13480
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