基因组测序展现布局变异影响桃农艺性状形成机制

 
 
基因组测序展现布局变异影响桃农艺性状形成机制  
 

克日，中国农业科学院郑州果树研究所（以下简称郑果所）桃种质资源与遗传育种创新团队连系美国康奈尔大学、新西兰植物与食品皇家研究院及华中农业大学绘制了桃全基因组布局变异图谱，并展现了基因组布局变异在桃驯化、改善及农艺性状形成中的重要脚色，为后续桃分子设计育种提供了重要依据。相关研究成就在线颁发在《基因组生物学》上。

郑果所研究员王力荣先容，研究团队以336份桃种质资源为质料，通过全基因组深度重测序判断到20多万个布局变异。在此基本上，理会了桃基因组的布局变异特征，发明高达98%的基因上有布局变异的产生；开展了果实成熟期、果实形状、近核处颜色等26个农艺性状的全基因组布局变异关联阐明，掘客了多个农艺性状的要害基因及其遗传变异机制。蟠桃是桃的变种，因其果型奇特，味甜汁多受到人们的喜爱，但蟠桃扁平果实形成的分子机理一直不明晰。该研究明晰了节制蟠桃形状的 PpOFP1 ，并发明蟠桃基因组中均含有一个1.67-Mb染色体倒位，而普通桃中则没有，正是该染色体倒位变异导致桃由圆变扁。

别的，该研究还掘客了节制桃近核处果肉颜色的 PpMYB10.1 及启动子区487-bp缺失变异，节制果实成熟期的 PpNAC72 基因及编码区9-bp插入变异。该研究掘客的优异基因对桃分子育种平台的成立提供了重要质料。此前该团队基于SNP变异开展了桃的遗传演化及农艺性状关联阐明，但基于SNP变异的关联阐明在基因掘客方面需要大量的后期事情，而此研究证实基于布局变异的全基因组关联阐明比SNP的关联阐明对候选基因简直定越发高效，为后续优异基因的掘客提供了重要参考。

该研究获得国度自然科学基金面上项目、中国农科院科技创新工程和国度园艺种质资源库配合扶助。

相关论文信息：https://doi.org/10.1186/s13059-020-02169-y

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