东亚更新世斑鬣狗化石古卵白研究获希望
东亚更新世斑鬣狗化石古卵白研究获希望
三个遗址点检测到的卵白质：a）山羊寨遗址 b）黑龙江肇东坤泥沟所在 c）灵仙洞遗址。
克日，中国科学院古脊椎动物与昔人类研究所饶慧芸、刘金毅和张驰，与中国科学院大学传授杨益民、哥本哈根大学传授Westbury以及南京师范大学副传授邵庆丰相助，报道了首例东亚更新世斑鬣狗化石的古卵白序列，并通过系统发育阐明，探讨了东亚斑鬣狗化石的分类及其与非洲现生种之间大概的基因交换。相关研究成就颁发在《科学陈诉》。
斑鬣狗（Crocuta Crocuta）是Crocuta属下独一的现生种，今朝仅漫衍于非洲撒哈拉戈壁以南，但在地质时期，它险些占据了整个欧亚大陆，称为窟窿鬣狗。今朝对付斑鬣狗的发源和演化汗青尚没有到达统一的认识，形态学、线粒体基因以及核基因获得的功效各不沟通。
然而，大大都的分子数据来自于欧洲，亚洲的研究开展较少，今朝仅有4个遗址点获取了有效的DNA数据，急需增补更大都据。
斑鬣狗化石在东亚遍及漫衍，在我国保留于更新世中期到全新世早期，今朝有数十处化石点发明，为科学家的研究提供了富厚的实物资料。有的遗址点，如灵仙洞（铀系测年>99 ka），开展了多次古DNA阐明，都以失败了却，思量到DNA生存的限制，本研究对包罗灵仙洞在内的中国北方三个遗址点的窟窿鬣狗举办了古卵白质阐明，均获取了多种内源性的卵白质。通过多酶切要领增加了肽段包围率，个中I型胶原卵白的包围率到达80%及以上，de novo测序团结数据库搜库阐明晰认了东亚窟窿鬣狗的多个突变位点。
这是首次获取到窟窿鬣狗的古卵白序列，为此后的相关研究提供了参考序列，并为东亚的窟窿鬣狗增加了新的分子数据。基于卵白序列的系统发育阐明表白东亚的窟窿鬣狗可分为两组，个中一组与非洲北部的现生斑鬣狗聚在一起，这与核基因获得的功效差异，反应了在1.03 Ma之前东亚的窟窿鬣狗与非洲北部的现生斑鬣狗大概存在基因交换。
该研究表白古卵白阐明在系统发育重建方面具有不凡的潜力，可在更长的时间标准和更辽阔的地区寻找分子证据。
该项研究由国度自然科学基金，中科院先导计谋专项（B类），现代古生物学和地层学国度重点尝试室开放课题和中科院青年创新促进会等项目扶助。
相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41598-020-73542-x。
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