首个油菜基因转录数据库构建乐成

 
 
首个油菜基因转录数据库构建乐成  
 

研究中所利用的油菜品种“中双11号”。油料所供图

克日，中国农业科学院油料作物研究所油料作物基因组学与抗病性改善创新团队破译了油菜基因组的全转录信息暗码，构建了油菜十万余个基因的转录全景图，使得油菜基因成果研究第一次有了尺度的可参考的基因转录数据库，将有力支撑油菜成果基因的相关研究。相关研究成就在线颁发于《植物学报》（The Plant Journal）。

团队首席科学家刘胜毅先容，油菜基因组包括约12亿个碱基和十余万个基因，如何解读这些海量的基因组信息成为成果基因研究的重要任务。

按照中心法例，基因通过转录形成mRNA再翻译成卵白质。由于基因的转录凡是存在多种可变的剪切方法，从而一个基因可以形成很多种差异的mRNA。此前，由于技能和资源的限制，油菜一直缺乏全基因组程度所有基因的转录mRNA数据库，导致油菜基因成果研究缺乏可查询和可参考的基因注释信息。

为了打破这一瓶颈，该团队回收最新的三代测序技能精确测定了油菜全长转录组，并自主开拓了一套用于多倍体油菜巨大基因组的分型要领，绘制了油菜基因组的转录全景图，构建了油菜的尺度参考转录本数据库。

该成就更新了人们对油菜基因和基因组的认识和领略，将为甘蓝型油菜成果基因和遗传改善研究及基因组设计育种提供数据基本和理论指导。

该研究获得国度重点研发打算项目、国度自然科学基金项目和中国农科院科技创新工程等项目扶助。

相关论文信息：https://doi.org/10.1111/tpj.14754

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