中美团队开发高精度生命全景时空算法工具
据新华社杭州电 （记者朱涵）杭州华大生命科学研究院联合美国斯坦福大学、我国武汉大学等高校和科研机构，开发出高精度生命全景时空算法工具“Spateo”，使空间转录组学技术能够精细地重构器官三维结构，系统地量化基因和细胞的时空动态过程。相关论文近日在国际学术期刊《细胞》上发表。
论文通讯作者之一、杭州华大生命科学研究院白寅琪博士介绍，空间转录组学技术能够准确反映细胞的空间排布和RNA的原位表达，是生命科学研究的重大技术创新，但使用这种技术所产生的大量原始数据，仍需要结合算法工具进行处理、分析，才能找到在空间分布上具有意义的细胞和基因表达。
“此前的算法工具大多侧重于空间原位信号的可视化，但缺乏系统性分析数据的方法。这是我们进行新型工具研发的原因。”白寅琪说。
据介绍，研究团队此次开发出的算法工具采用数学建模方式，具备三维重建、区域数字化、细胞间相互作用推断、宏观组织与微观基因关联以及用于交互式操作的可视化界面等功能。
为验证性能，研究团队以小鼠胚胎和果蝇发育的研究为例，探索了三维空间中随时间变化的器官生态形成机制，并构建了小鼠胚胎发育的“3D分子全息图”。
“新工具将显著提高科研人员对发育过程中器官形成的理解，帮助科研人员进一步从时间和空间维度上认知基因、细胞，为推进胚胎发育、脑科学、疾病等多个领域的研究提供支撑。”白寅琪说。
(责编：袁勃、赵欣悦)
分享让更多人看到
推荐阅读
服务认证需求持续扩大 全国获证组织超4.99万家
人民网北京11月16日电 （记者孙博洋）记者从中国消费品质量安全促进会了解到，11月13日，由中国消费品质量安全促进会主办的服务认证良好案例经验交流活动在辽宁大连举办。
推动服务业高质量发展关乎社会大局，近年来服务认证需求持续扩大，全社会、全行业更加重视、更加广泛深入地开展服务认证工作。…
推动民营企业高质量发展 业界聚焦品牌建设
人民网北京11月16日电 （记者孙博洋）11月13日至14日，2024中国民营企业投融资洽谈会（简称“民洽会”）在天津举行。在同期举行的民洽会大国品牌合作交流会上，专家学者对民营企业高质量发展与品牌建设进行了交流。…
