2019诺奖化学奖会给生物学家吗 这种DNA验证技术呼声高
2019诺奖化学奖会给生物学家吗 这种DNA验证技术呼声高
诺贝尔生理或医学奖已然揭晓,但生物学家们还有机会。
据统计,1990年以来,有16次诺贝尔化学奖颁给了生物学方面的成就。以2017和2018年为例,诺贝尔化学奖就分别颁给了发明冷冻电镜和对活性蛋白质的定向进化研究。
被称为诺贝尔风向标的引文桂冠奖,今年其化学奖也有两项与生命科学密切相关,当看到Southern(直译“南方”)的鼎鼎大名时,记者当即决定“押宝”这个无处不在的DNA验证技术。
Southern印迹法由埃德温·萨瑟恩(Edwin Southern)在英国医学研究理事会从事科学研究时发明,相关论文首次发表时他仅仅35岁,以他名字命名的DNA印迹技术,可用于确定特定DNA序列,并判断其功能、是否变异、图谱位置等,他后续还发明了DNA芯片等技术。引文桂冠奖称他的发明是高通量核酸分析工作及基因图谱、诊断和筛查的开端,也是当今个性化医疗的基础。
可检测遗传病中的单基因突变
2007年江苏省高考生物学试卷中有一道关于Southern印迹法的试题,题目给出Southern印迹试验后获得的图像,请学生判断不同的条带说明了什么生命科学意义——
单基因遗传病可以通过核酸杂交技术(Southern印迹法)进行早期诊断。镰刀型细胞贫血症是一种在地中海地区发病率较高的单基因遗传病。已知红细胞正常个体的基因型为BB,镰刀型细胞贫血症患者的基因型为Bb。有一对夫妇被检测出均为该致病基因的携带者,为了能生下健康的孩子,每次妊娠早期都进行产前诊断。题目给出产前核酸分子杂交诊断和结果示意图。根据凝胶电泳带谱分析可以确定胎儿是否患有镰刀型细胞贫血症。
其中提到的B和b体现在DNA上仅仅是一个碱基的区别,如何能够将其区分开来呢?Southern印迹法做到了。
它的原理可以形象理解为“钓鱼执法”和“打出原形”两步——
B和b由于一个碱基的不同在不同的酶切反应中就会反应不同,通过特定酶的“钓鱼执法”,两种基因“你向左,我向右”,但在外表还看不出来,这时候“锁住原形”(转移到尼龙膜等能锁住DNA的膜上)通过可显影的放射性同位素等做标记,让探针DNA把锁住的原形呈现出来,实现“可视化”。由此,通过Southern印迹法,些微的DNA突变可以被检测出来。
题目中提及的镰刀型细胞贫血症的基因基础,正是萨瑟恩1978年利用该方法发现的。与此同时,萨瑟恩决定使用分子生物学方法对人类基因组进行作图。为了这个计划中大规模序列分析的需要,萨瑟恩进行了多项技术革新,包括使用凝胶电泳对经限制性内切酶切割后的片段精确分子量的确定、根据凝胶结果对DNA序列进行自动读取等。
衍生出对蛋白等生命分子的检测方法
由于以萨瑟恩名字命名的Southern印迹法与“南方的”英文一样,随后诞生的其他印迹法分别以Northern、Western命名。
当待分析的物质由DNA转变为RNA时,“南”变成了“北”。军事医学科学院基础医学研究所蔡仕英等在介绍《电泳的原理、应用及进展》中提道:在电流作用下,萨瑟恩成功地将DNA片段从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维膜上进行分子杂交分析,因此称为Southern印迹法。后来,艾尔文(Alwine)用类似方法也成功地将RNA从电泳胶中转印到硝酸纤维膜上作分子杂交分析,但他并没有称这一技术为Alwine印迹法,而是称之为Northern印迹法,以便与Southern印迹法相对应。