快速检测新冠病毒,有哪些新科技

光山新闻网 林晓舟 2020-02-13 10:48:28
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快速检测新冠病毒,有哪些新科技  
 

新型冠状病毒(2019-nCoV)引发的疫情引起了全国乃至全世界人民的关注。其中,有一个问题引发了广泛讨论:为什么确诊人数在2020年1月18日之后出现了爆发性增长?中国为什么能快速检测新冠病毒?

作为生物检测技术的研究者,笔者希望借此机会跟大家探讨一下,如何诊断一个新发病原体,如何快速检测新冠病毒。

核酸检测需要多久

1月9日,本次不明原因的病毒性肺炎病例的病原体初步判定为“新型冠状病毒”,能否快速,准确地检测到它,成为防控的关键。

在特异性的诊断方法出现之前,只能根据患者体征找到一些疑似病例。很不幸的是,这次的新型冠状病毒肺炎症状上特异性不强。与SARS相比,此次肺炎起病并不很急,有些患者甚至没有出现高烧。在这个流感横行的季节,单靠病人体征这种太过粗糙的方法区分新型冠状病毒感染者是非常困难的事。

1月16日,首批针对新型冠状病毒生产的PCR试剂盒下发到各省级疾控中心,这是近几日出现确诊病例数量快速增长的直接原因。

冠状病毒检测PCR试剂盒的工作原理大致是:通过提取病人样本中的RNA,进行反转录·聚合酶链反应(RT-PCR),通过扩增反应将样本中微量的病毒信息加以放大,最后以荧光的方式读取信号。如果PCR之后信号为阳性,那么就可以说样本中存在病毒(已经感染),反之则说明没有感染。

一次检测需要多长时间

初期大约需要16小时(本文数据根据常规的实验室操作时间推测,不代表实际用时)。

引发本次肺炎的新型冠状病毒,和它的近亲SARS,MERS一样,遗传信息都是由单链RNA构成。想要完成对它的检测,至少需要经过提取病毒RNA,和逆转录PCR(RT-PCR)两步。提取病毒RNA本身也包含裂解样本,提纯RNA等多个工序,需要花费数小时。而RT-PCR,一般来说也需要至少三四个小时才能完成。整套工序流水线操作的话,总共大概需要一个工作日,即6-8小时左右,检测结果都需要经过复核,重复实验则需要花费双倍的时间。

这样算下来,从1月16日湖北省收到国家疾控中心下发的试剂盒到1月18日通报第一批检测结果,负责检测病毒的工作部门可以说是马不停蹄了。在此基础上,目前有机构开发出了简化版的试剂盒,可将单次检测的时间缩短到约3小时。

怎么研发生产试剂盒

有的朋友可能还有疑问,从发现第一例患者到试剂盒下发,中间经过了一个月左右,研发生产试剂盒为什么需要这么久?

其实,已经很快了,我们来捋一捋试剂盒的开发流程:

病原分离和排查:此次导致疫情的病原是一种全新的冠状病毒。在确认这是一种从没有见过的病原之前,需要排除掉所有已知病原:包括各类流感病毒(甲型流感、禽流感等),容易导致普通感冒的腺病毒,鼻病毒和已知能导致肺炎的冠状病毒(SARS、MERS),衣原体,支原体等等。

设计引物:这是非常关键的一步,只有设计出适当的引物,才能进行病毒检测的PCR反应。科学家需要对这个新找到的病毒进行全基因组测序和生物信息学分析,设计引物(就是一段DNA序列),验证它的特异性,敏感性,确保它只能识别新型冠状病毒基因。

工业化生产:可以说,除了引物,所有病毒核酸检测试剂盒中的其他组分都是一样的,所以大量合成适当的引物就是工业化生产试剂盒的关键。

病原分离和排查需要花费至少一周的时间,测序和生物信息学分析也需要三天左右。探针设计与特异性检查又需要两三天。也就是说,在一切都非常顺利的情况下,也需要将近两周的时间才能把设计好的引物投入工业化生产。目前,我国工业化DNA合成技术已经推广得非常普遍,一两天的时间足可以生产出大量的产品(有些小剂量定制产品甚至可以当日送达)。综合各方面信息来看,这次疫情,我国最起码在检测手段的开发上做到了近乎完美的快速响应。

除了核酸检测,蛋白检测也在路上

除了目前卫生系统所采用的核酸检测方法以外,基于病毒蛋白的检测技术也可以在病原的快速检测上起到很大作用。