《科学》刊发美国研究：纽约新冠病毒主要由欧洲和美洲引入

 
 
《科学》刊发美国研究：纽约新冠病毒主要由欧洲和美洲引入  
 

最新研究显示，美国疫情最严重的地域——纽约的新冠病毒主要由欧洲和美洲多次独立引入。

以上结论来自美国西奈山卫生系统（Mount Sinai Health System）于内地时间5月29日刊发在国际权威期刊《科学》杂志上的研究。该研究题为《SARS-CoV-2在纽约市的引入赶早期流传》（Introductions and early spread of SARS-CoV-2 in the New York City area）。

纽约市已成为当前SARS-CoV-2大风行的中心之一。为了确定病毒在纽约市区的早期快速流传事件，研究者对在西奈山卫生系统（Mount Sinai Health System）寻求治疗的新冠患者病毒举办了基因测序。对84个差异的SARS-CoV-2基因组的系统发育阐明表白，纽约的新冠病毒主要来自欧洲和美国其他地域的多个彼此独立的引入。另外，研究者还发明白SARS-CoV-2的社区流传证据，这与居住在都市差异社区的患者中发明的相关病毒群集有关。

新冠病毒(SARS-CoV-2)是一种新型病毒病原体，在已往几个月中新冠病毒在全球迅速伸张，世界卫生组织(WHO)于2020年3月11日公布大风行。美国于2月2日对中国、3月2日对伊朗、3月13日对欧洲大陆国度、3月16日对英国和爱尔兰实施了观光限制，以防御国际输入病例。

尽量采纳了这些法子，纽约州的第一例新冠确诊病例照旧于2月29日呈此刻了纽约市。在3月的头几周，跟着筛查本领的扩大，纽约新冠病例数迅速增加。停止5月2日，纽约州共有312977例新冠确诊病例，个中纽约市172354例(占纽约州55%)。纽约市已成为美国SARS-CoV-2传染的主要中心之一，其多半市地域高出13300人灭亡。

位于西奈山伊坎医学院的病原体监测项目(PSP)是一个多学科、机构性的基本设施，旨在发生高判别率、近乎及时的病原体遗传信息，这些病原体在来自那些在纽约西奈山卫生系统寻求治疗的大量、多样的患者。基于Illumina公司和Pacific Biosciences公司的新一代测序技能，通过生物pecimen编码、核酸提取和qPCR定量，PSP提供了病原体基因组的信息。

研究者操作现有的PSP基本设施观测了在纽约市流传的SARS-CoV-2毒株的来历，并阐明白该病毒在人口麋集的多半市地域的流传环境。该研究展示了90个SARS-CoV-2疏散毒株的基因组多样性，这些毒株来自于2020年2月29日至2020年3月18日在西奈山卫生系统寻求治疗的84名患者。

这些基因组表白：2020年3月的头几周，是多个独立的来历将SARS-CoV-2引入纽约市。基于对全长病毒基因组序列的遗传相似性和系统发育阐明，在纽约州首次陈诉新冠病例后的18天内诊断的大大都病例好像与未追踪的流传和潜在的观光相关袒露有关。值得留意的是，大大都的病毒引入都来自欧洲和美国。研究者还确定了两个病毒簇，共21个密切相关的病例，表白社区流传已经存在。

这些调查功效也获得了这些病例在都市内陆理漫衍的支持，对应纽约市的4行政区中的3个，以及纽约州的5个县。数据表白，一旦SARS-CoV-2由多个独立来历引入并产生社区流传，再对前往纽约实施观光限制对防范多半市地域流传浸染有限。

疫情开始时，小我私家要得到SARS-CoV-2的测试必需切合美国CDC的一套严格的筛选尺度，而且需要得到内地卫生部分的核准，这对纽约市的新冠测试是极大的限制。3月9日至3月14日间，环境产生了转变，纽约西奈山医疗系统(MSHS)的新冠筛选本领获得大大扩展，于是新冠确诊病例激增。这一周内，天天的SARS-CoV-2阳性检测数量是流感病毒阳性检测数量的5倍多。

研究者对临床疏散出的90个SARS-CoV-2基因组举办了测序，这些病毒来自停止3月18日确诊84个患者（其时纽约周已有高出800确诊病例），共发生了72个完整的和18个部门（包围率> 95％）的新冠病毒基因组。这些病例来自纽约市4个行政区(曼哈顿、布朗克斯、皇后区和布鲁克林区)的21个社区，以及韦斯切斯特县的两个城镇。