最具熏染性新冠病毒如何从预印本“走向”印刷本(2)
研究人员还有增添了更多数据:当论文在同行评审后进行修改时,大约全球有30000个SAR-CoV-2序列可供使用,而在提交预印本时大约只有6000个。“更丰富的数据集支持了我们最初的观察结果,并让我们对结果更有信心。”Korber说,“我们现在的研究表明,在几乎所有案例中,G614都有所增长。这一模式几乎没有例外,我们在论文中详细描述了冰岛和加州的圣克拉拉。”
研究人员还能够获得额外的临床数据(他们分析了999名英国患者,而预印本只有470名)表明感染了G变种病毒的患者有较高水平的病毒RNA,这有时与体内病毒载量较高有关。但两种变异的住院结果没有差异。
或许最重要的是,修订后的论文现在包含了两组独立进行的实验的结果,这些实验评估了G变种的传染性,在拉霍亚免疫研究所的Erica Ollmann Saphire实验室和杜克大学的David Montefiori实验室完成。研究人员用甘氨酸替换改造了该病毒的版本,然后在培养皿中测试它们感染人类细胞的效率。
Montefiori说:“表面含有G型刺突的病毒颗粒的传染性大约要高3~6倍。因为两组病毒颗粒之间的唯一区别是在614位置的D和G,增加的传染性可以直接归因于D614G突变。”他指出,这些发现有局限性,研究人员不能使用野生型病毒,也没有研究SARS-CoV-2自然靶向的呼吸系统细胞。在现实生活中,病毒在人与人之间的传播还涉及其他一些可能无法解释的因素。他说,尽管有局限性,但这些发现令人兴奋,因为“它们为G型病毒在全球迅速传播提供了一种可能的生物学解释”。
“这似乎是一种更具适应性的病毒。”Saphire同意道。她的实验室还证明,圣迭戈地区6名COVID-19康复者体内的抗体在中和D和G变种方面同样有效。她指出,这些人被感染时D和G变种都在传播,所以团队不能确定他们感染的是哪种类型。但该研究结果仍然表明,不需要更高浓度的抗体来中和明显“更具适应性”的新变异,尽管它产生的病毒RNA水平更高。“这是个好消息。”她说,“人类恢复期血清对变种的中和作用也一样好,甚至可能更好一些。”这一结果表明,对于这种特殊的变异,已经在开发中的治疗方法和疫苗——主要集中在刺突蛋白上,而且通常基于在武汉测出的病毒的原始版本——可能仍然同样有效。
Korber和同事们仍然对他们当时发表了预印本感到高兴。“我们仔细权衡了我们的选项设置。”Korber说,“这些实验测定并不容易开发,在我们发表预印本几周甚至几个月之后,才证明这个评估是正确的。让G614变种立即进入队列进行进一步研究似乎很重要,我们觉得我们的预印本加速了对D614和G614 刺突变异的比较。我们和其他人现在已经弄清了这两个变种在传染性上的明显差异,我们能够加入到一个新的合作努力中来,这在一定程度上是由预印本实现的。”
Saphire说:“序列变化的计算分析总是比湿式实验室实验(即传统实验)快。尽管冠状病毒具有一些校正能力,但突变可能会出现,对病毒的警惕、监控和持续研究将是确保药物、抗体和其他正在开发的干预措施仍然有效的关键。这就是建立这条通道的原因:检测突变以便及时制造必要的试剂、培养必要的病毒,并做实验了解是否有效果。”
“G614的全球扩散,无论是自然选择还是偶然,都意味着这个变种现在大流行。”Grubaugh在他的评述中指出。不过对于普通公众来说,他认为这些结果并没有带来太大改变。“突变和进化是大流行病的自然组成部分,病毒就是病毒。”他说,“其中一些可以轻微改变病毒的‘行为,但它们不是能使病毒突然成为当下威胁的开关。”