鼻咽癌肿瘤微情况单细胞图谱构建

光山新闻网 林晓舟 2020-07-25 07:18:04
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鼻咽癌肿瘤微情况单细胞图谱构建  
 

鼻咽癌是一种奇特的头颈癌,该癌肿的漫衍在地区上极不服衡:在东亚和东南亚出格是中国南边高度风行,也被称之为“广东瘤”。

鼻咽癌的发病从病因上与EB病毒(EBV)传染高度相关,而且病理学特征表示为肿瘤病变周围和内部的免疫细胞高度浸润,该非凡的微情况特征表白免疫治疗在鼻咽癌中具有极好的应用潜力。事实上,以免疫查抄点抑制剂为代表的免疫治疗已在鼻咽癌患者中取得了不错的临床受益。

然而,鼻咽癌患者对付抗PD-1疗法的回响率只有20%~30%,这表白我们需要加深对鼻咽癌肿瘤微情况的领略,从而摸索更多有效靶点以及可用于风险分层的生物符号物。

克日,中山大学肿瘤防治中心、深圳华大生命科学研究院、中山大学生命科学学院与中国科学院深圳先进技能研究院等单元相助完成的最新研究成就在《细胞研究》杂志上在线颁发。这项事情首次从单细胞程度上系统全面地构建了鼻咽癌的肿瘤微情况图谱,对鼻咽癌肿瘤细胞的异质性和免疫细胞的多样性举办了深入阐明,判断了一系列与患者预后密切相关的分子特征及潜在的治疗靶点。该研究在单细胞程度上展现了鼻咽癌的细胞异质性,为鼻咽癌的精准治疗奠基了新的基本。

在此研究中,研究人员首先通过单细胞转录组测序技能得到了48584个单细胞数据,构建了包括肿瘤细胞和免疫细胞在内的全面的鼻咽癌肿瘤微情况图谱。通过对肿瘤细胞举办非负矩阵阐明,界说了鼻咽癌肿瘤细胞内5个普遍的瘤内异质性特征基因集,个中Epi-differ 2基因集与EBV传染正相关,并富集TMPRSS2等介导病毒进入宿主细胞的基因,这表白Epi-differ 2基因集大概与EB病毒传染鼻咽上皮细胞的历程密切相关,有望成为过问靶点。

另外,研究人员判断了23种差异的免疫细胞亚群,并在此基本上,通过单细胞调控网络阐明展现了影响免疫细胞多样性的要害转录因子,并证实了NR1H3和TFEC等调控因子大概在鼻咽癌抗肿瘤中发挥浸染。

研究人员发明鼻咽癌的成果失调性T细胞泛起一种“激活依赖性的成果失调”状态,即当T细胞的细胞杀伤本领加强时,免疫查抄点分子的表达也随之增高,二者呈正相关状态。

出人意表的是,临床上最常见的免疫查抄点PDCD1和CTLA4与T细胞的杀伤毒性关联性并未到达显著程度,而LAG3和HAVCR2不只与GZMA/GZMB的表达以及瘤内浸润淋巴细胞强正相关,进一步的尝试证实与肿瘤间质的CD8+ T细胞对比,LAG3和HAVCR2在肿瘤癌巢内的CD8+ T细胞中表达显著上调,表白LAG3和HAVCR2在鼻咽癌中或可作为比PDCD1更为有效的免疫治疗靶点。

该研究同时成立了免疫细胞亚群特异的基因集,并证明白巨噬细胞,浆细胞样树突状细胞,CLEC9A+树突状细胞,自然杀伤细胞和浆细胞的基因集与精采的保留了局显著相关,可作为鼻咽癌有效的预后分子指标。

综上所述,该研究首次构建了全面的鼻咽癌单细胞图谱,并搭建了人类鼻咽癌蓝图阐明网站。该研究数据将成为摸索鼻咽癌肿瘤微情况的资源宝库,敦促该癌种治疗在个别化精准诊疗时代的不绝打破,造福宽大患者。

相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41422-020-0374-x

 

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